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策就英年早逝，这对程普来又是一个晴天霹雳。
孙策死后，周瑜等人拥立孙权继承孙家大业，周瑜的地位则再次达到了尖。或许是因为周瑜排挤外难，拥立自己为主的缘故，孙权特别尊重周瑜，也十分乐意把军中大权交给周瑜来执掌。在很多时候，周瑜到像是一个在外面征战沙场的君主，而孙权到像是一个在后方持力家务的丞相大臣。
这样的问题，自然会使得程普再次愤怒，与周瑜之间的矛盾也愈加深刻。尤其是周瑜令甘宁前往夷陵据守，曹仁分攻，甘宁被困发出求救。此事诸将皆是予以兵马较少，无法分兵营救，而当时周瑜有兵马两万，而程普是领兵马一万。此刻多亏了吕蒙从中调停，并献出良策，才救出了甘宁，故而吕蒙事后所的，几败国事就是指得此事。
事后孙权令孙皎与吕蒙为左右部大都督，吕蒙便立即站出来对着孙权的：“昔日周瑜和程普为左右部督，共攻江陵，虽事决于周瑜，但是程普自持军中老将，且俱是督，遂共不睦，几败国事，此目前之戒也。”孙权听后立即恍然大悟，有此看来程普与周瑜之间的矛盾，是整个江东上下都知道的事。