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有了独立思维，然后其中的一种生物也许是人类，也许是其他物种）制造出了电脑或类似功能的东西）并且他们也开始研究思维程序和人工智能或其他智能），但他们始终是盒子电脑）中的生物。
他们也许不知道，也许知道他们只是一种程序。同样，推理开来，我们呢？我们就真的真实存在吗？我们之外宇宙之外）又是什么呢？也许是台电脑，也许我们整个宇宙只是另一个物种的黄粱一梦，我们也是某个“盒子”中的生物。这就是盒子理论。
说简单点，就是我们有可能是一个电脑里一个程序或者物种，这个电脑就是一层盒子，而这个盒子也可以说成是我们的这个世界。