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琉球当地土著部落不是不战而降就是战败被杀，至此，流求被全部平定！
此时归顺朝廷的土著共有十万余人，有了这些劳动力大大加快了港口的建设速度。但仍然有不到千人的残兵败将躲到密林深处与大晋对抗。不过这已经影响不到大局，琉球正式成为大晋版图中的一部分。
在这片新征服的土地上，司马遹下旨设琉球郡，调一部分官吏补充到此地任职，并在基隆港设立琉球都督府暂时由李肇兼任琉球都督，负责指挥琉球当地所有军事力量。在征服了琉球后，司马遹命内阁开始着手往该地迁移民众。
预计三年后，加上归化的土著和移民，争取让琉球人口达到二十万左右，有了充足的人口，朝廷才能有效地开发琉球大岛。
为了教化岛上的土著，郡守府一上任就着手建立学堂，并招收当地土著少年数百人入学学习汉家文化。郡守府甚至向当地人承诺，如果他们愿意还可以到大陆学习并参加朝廷举行的科考！
与此同时，大晋先进的生产技术也开始传入琉球，极大促进了当地的经济发展！
征服了琉球群岛后，大晋海军算是控制住了大陆至曰本群岛之间的海域，夺取这些“弹丸小岛”，可以使占据技术优势的大晋海军以琉球岛屿为跳板，从南边对江东形成战略包围，为大晋以后渡江平定江东割据势力打下伏笔。
在大晋海军忙着征服南方的琉球群岛时，北方朝鲜半岛的局势进一步恶化，为此司马遹不得不召开内阁会议对此展开讨论！(未完待续。)