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于孝天在一边大批招募移民屯耕台湾岛的同时，也开始大举展开了军事行动，派出了大量的手下兵将，分头赶往各地，对那些渐成气候的匪盗团体进行进剿，这些基本上以饥民为为主要力量构成的乱贼，面对着精锐的海狼的军队，根本就毫无还手之力。
不管是他们正面迎战，还是化整为零潜入山中，都无法挡住于孝天麾下的兵将对其进剿，于孝天麾下的陆军，最初成型就是在台湾岛上的山林之中，和那些生活在山林中的土著进行作战，积累起来了相当丰富的山地作战的经验。
福建多山，虽然很利于山贼活动和隐藏，但是那也只是针对普通的官军来说，当他们对上了精于此道的海狼的步兵的时候，那些海狼的步兵往往展现出极强的山地作战的能力。
往往海狼的兵将，都可以用小股兵力，在山中追踪到山贼，以各个击破的办法，逐渐将大股山贼削弱，最终将其彻底剿灭。
这样的本事对于普通的福建官军来说，根本是不敢想象的，海狼的步兵往往敢以几十人或者多一些也就是一二百人，便敢于孤军深入到深山老林之中，对山贼进行追剿，往往还能取得大胜，可是对于普通的福建官军来说，即便是借给他们一堆的胆子，他们也不敢贸贸然就轻易追入山林之中。
所以在崇祯元年的下半年之中，于孝天可谓是高歌猛进，捷报频传，几乎每天都有大大小小的奏捷的战报被呈送到福州城之中的巡抚衙门和主持军务的都指挥使司，让熊文灿以及这些官员们，无不感到瞠目结舌。u