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忽然爆炸开来，所有的幻影神奇宝贝全都彻底消失。
“这是怎么了？”小智等人面面相觑，诧异不解。
还不等找出答案来，地面上时的能量坐标突然放射出奇异的能量波动，紧接着化石翼龙等化石神奇宝贝大规模的以数据形式出现。
“为什么啊？我的操纵器明明已经毁掉了，怎么会出现这么多的神奇宝贝？”荣格博士惊声道。
“哈哈哈”
就在这时候，二楼的阳台，一阵大笑声突兀响起，一个将浑身裹得严严实实，看不清样貌的人出现在那儿道，“荣格博士，你所发明的幻影系统，从现在开始就属于我了。”
“你说什么？你到底是谁啊？”小智质问道。
“你们就称呼我的幻影的主谋者吧。”神秘人冷笑道。
“你拿我的幻影系统，是想干什么？”荣格博士质问道。
只是这一次，神秘人没有回答他，而是让制造的幻影化石翼龙朝荣格博士扑去，荣格博士极力挣扎，却被化石翼龙轻易抓上天空。
“荣格博士。”大木博士脸色顿变，但想到旁边还有小智几个人，还是关心的情绪占了上风，喊道，“我们快走，这些幻影神奇宝贝太多，我们不好对付，先跑到外面去。幻影神奇宝贝只能在幻影系统的范围内活动。”
“好。”。
小智虽然还有想要继续留下来战斗的想法，但是也考虑到小胜几个，还是先跑再说，一群人朝着门外飞快跑去。
小智几个人跑步迅速，先一步跑了出去，但是大木博士却跑得慢了些，结果也被一只化石翼龙抓走。