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乡镇集体企业就掀起了改制的热潮，这时候的乡镇企业改制方式主要是转变为股份合作制，也就是企业的管理人员和工人根据他们在企业里的职务、工作年限等指标购买本企业的股份，同时地方n也保持一定的股份。到九七年，全国实行改制的乡村集体企业达到了52万家，占总数的百分之三十多，其中多数为股份合作制。而东部沿海地区的改制比例远高于这个数字，浦江市达到了百分之七十，江南省的一些县市达到了百分之十以上。
也就是说，到了九九年包飞扬来浦江上任的时候，汇浔区的乡镇企业大部分已经经过了第一次的改革，变成了股份合作制。当时学术界普遍认为股份合作制吸收了股份制和合作制各自的优点和优势，克服了各自的缺点，形成了一种独特的新型的企业产权制度，实现了所谓的生产资料的共同占有与职工的个人所有相统一、劳动者与所有者相统一、按劳分配与按股分配相统一、风险共担与利润共享相统一，是一种富有创新意义的现代企业制度。
不过，也有一种观点认为股份制与合作制是两种不同的企业财产组织形式，一个企业要么实行股份制，要么实行合作制，不可能同时实行这两种制度，也不可能将这两种制度结合在一起。
事实证明，反对者的声音虽然刺耳，但还是有道理的，从去年开始，一些乡镇企业又开始进行第二轮改革