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公司内部经营管理混乱，任人唯亲，贪污腐化，效率极低，直接用到修路上的资金并不多。针对这一情况，李秉衡专门派了人过去协助张振勋管理铁路公司，杜绝各种丑恶现象。张振勋亲自主管招标定购材料设备的决定权，行政人员与工程技术人员一旦发生因私立而产生矛盾的一律开除。
李秉衡记起后世看到的川汉铁路修建中的一项丑闻，1909年川汉公司驻上海的经理施典章挪用300余万两路款进行股票投机活动，亏损殆尽，导致资金短缺的川汉铁路雪上加霜。他立即让张振勋找了个借口将施典章，既除了隐患，又杀鸡儆猴，给张振勋立了威。
西门子公司在德国承包电气化铁路工程已有近三十年的历史，相关的经验丰富，当他们得到李秉衡拥有川汉铁路与华南铁路公司的决策权的消息后，立即提出合资成立中国电气化铁路公司，承包川汉铁路的电气化工程。
李秉衡考虑到国内修筑铁路的不易，趁着这个机会直接修筑电气化铁路也是好事。一条电气化铁路相当于两条普通铁路的运载能力，并且运输成本低，维修少，机车车辆周转快，消耗的能源成本也低，没有污染。
反复权衡后，他还是决定跟西门子公司合作在川汉铁路上试验电气化铁路，这也将是中国第一条电气化铁路。！