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破审理的，而锦衣卫审理的案件，直接向最高领寻明成祖负责，地方官府根本无权过问。
杨秋池的密报上去一个多月之后，皇上明成祖下旨，将保宁府锦衣卫百户所百户周法海及其参与围杀杨秋池地锦衣卫们，全部凌迟处死，并株灭其九族，同时下令全国海捕在逃的锦衣卫。后来也一一缉捕归案，凌迟处死。
对船帮参与私盐武装贩运者，和后来赶来增援的船帮帮众，不分主从，比照“强盗已行得财律”，全部处以斩立决，并对负责人陆渐离、保宁府同知罗慕天，及其船帮负责私盐贩运地骨干成员，全部枭首示众。
对保宁府知府赵新乐御下不严，处杖一百，发俸半年。
此外，下令对在逃的船帮保宁府大掌柜陆渐离、船家商行帐房先生王雄剑、原保宁府锦衣卫百户所樊总旗进行全国海捕。
几个月后，除了大掌柜陆渐离一直下落不明之外，樊总旗和王雄剑相继被锦衣卫密探发现踪迹，抓捕归案，樊总旗被凌迟处死，王雄剑被斩立决。这是后话，按下不提。
明成祖同时下旨，对这次在征剿船帮私盐船队和保宁府锦衣卫叛贼战死的将士厚加抚恤，对南宫雄、夏萍、徐石陵、石秋涧等护卫保护特使及其家眷有功的护卫队员们，和这次战斗中立功的将士们给与了丰厚地奖赏。