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在这次攻击计划中，rì军计划投入战列舰11艘，重巡洋舰13艘，轻巡洋舰9艘，驱逐舰68艘，潜艇24艘，扫雷舰5艘，运输舰16艘，后勤补给舰21艘，飞机150架，陆军8600人，海军2.3万人的庞大兵力。战役最高指挥官为联合舰队司令山本五十六海军大将。
该计划规定7月2rì侦察编队的巡洋舰进入济州岛以东海域的预定阵位，建立三道jǐng戒线；7月4rì对济州岛进行空袭，压制消灭岛上的中国驻防兵力，随后进至济州岛以北海域一面支援登陆作战，一面准备迎击中国舰队的反击，待夺取济州岛机场之后，其岸基飞机立即转至岛上；7月6rì登陆编队实施对济州岛的登陆，之所以选择6月7rì为登陆rì，因为那是7月中一个有月光的夜晚，可见度较好，主力编队于7月7rì抵达济州岛西北海域，为登陆编队提供火力支援，并与中国舰队展开海上决战。
整个计划组织严密，规模宏大，rì本海军可以说是倾巢而出，几乎投入了所有能动用的舰艇。这一行动的耗油量几乎相当于rì本海军在和平时期一年的耗油量，甚至还有人说所有参战军舰的甲板面积总和比济州岛的面积还大。
6月18rì，参加济州岛登陆作战的指挥官一木清直陆军大佐来到“大和”号，接受山本关于作战计划的指示。至此，各参战部队都已领受了作战任务。
6月20rì，山本发布各部队作战部署的最后命令，考虑到联合舰队还需要七天才出海，为了不白白浪费这几天，联合舰队组织了为期两天的大规模实战演习。